RasMol

RasMol

Description de cette image, également commentée ci-après
Juxtaposition 3D de molécules avec RasMol
Informations
Première version
Dépôt sourceforge.net/p/openrasmol/code-0/HEAD/tree
Écrit en C
Système d'exploitation Unix
Formats lus Protein Data Bank (en)
Type Science
Bioinformatique
Licence Licence publique générale GNU
Site web www.rasmol.org

Structure de protéine en mode ruban
Crédit image:
licence CC BY-SA 2.5 🛈
Exemple d'un rendu de structure de protéine en mode "ruban" par RasMol

RasMol est un logiciel de graphisme moléculaire gratuit permettant de représenter des molécules en 3D à partir de différents formats standards de fichiers de représentation de molécules. Il fonctionne sur plateformes MacOS, Windows et Linux. Les types de fichier acceptés par RasMol sont entre autres les formats :

  • PDB (Protein Data Bank)
  • MDL (Molecular Design Limited)
  • MSC (Minnesota Supercomputer Center)
  • CIF

Il utilise les possibilités des cartes graphiques 3D pour faire tourner en temps réel dans l'espace les molécules importées, puis éventuellement le nouvel ensemble de molécules ainsi assemblé.

Il permet de combiner plusieurs types de représentation : rubans, bâtons, boules et bâtons, points, boules (CPK).

Il en existe une version open source appelée OpenRasMol.

Notes et références

Lien externe

Articles connexes