Entre 1997 et 2000, Raphaël Jeune se distingue chez les amateurs en obtenant plusieurs victoires et diverses places d'honneur, sous les couleurs du CC Étupes. Il passe ensuite professionnel en 2001 au sein de l'équipe CSC-WorldOnline. Avec cette formation, il termine troisième d'une étape de la Ster Elektrotoer et quatrième de l'Étoile de Bessèges.
Il met finalement finalement un terme à sa carrière sportive à l'issue de la saison 2002 pour travailler chez Look, en tant que responsable sponsoring[1],[2].