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Patrick Cocquyt devient coureur professionnel en septembre 1982 au sein de la formation belge Safir-Marc-Concorde. Dès ses débuts, il se distingue en remportant une étape ainsi que le classement par points du Tour de Catalogne. L'année suivante, il s'impose sur une étape du Tour d'Aragon. Il se classe notamment huitième de l'Amstel Gold Race.