Lokiarchaeota

Lokiarchaeota
Classification
Domaine Archaea

Embranchement

Lokiarchaeota
Spang et al. 2015

Classification phylogénétique

Position :
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Mikenorton
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Principales caractéristiques bathymétriques et topographiques de l'océan Arctique. La dorsale de Gakkel (Gakkel Ridge) où l´on a découvert l'existence de lokiarchaeotes, est à la droite de la carte, au nord de la Sibérie et de l'Europe, et atteint la partie nord de l'océan Atlantique.
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Hypothèse éocyte  proposant un ancêtre commun aux archées et aux eucaryotes.

Lokiarchaeota est un phylum des Archaea défini en 2015[1].

Description

Ayant été découvert par des analyses métagénomiques, ses caractéristiques morphologiques ne sont pas connues. La nomenclature de ce taxon a été officiellement introduite en 2015, après l'identification d'un génome considéré Candidatus pendant l'analyse métagénomique[2],[3] d'un échantillon de sédiments du fond océanique.

L'échantillon sédimentaire a été obtenu près d'une source hydrothermale dans une formation rocheuse connue comme le Château de Loki (Loki's Castle, en anglais) sur la dorsale de Gakkel dans l'Océan Arctique[1].

L'importance du phylum Lokiarchaeota provient du fait que l'analyse phylogénétique démontre l'existence d'un groupe monophylétique composé de lokiarchaeotes et d'eucaryotes[4],[5],[6], ainsi que de la présence de plusieurs gènes ayant des fonctions associées à la membrane cellulaire. Il permet d'apporter une pierre à l'édifice de la connaissance de l'origine des eucaryotes, une des hypothèses proposant que l'ancêtre commun des eucaryotes soit proche des Archaea[7],[8],[9],[10],[11],[12].

Références

  1. ↑ a et b (en) Anja Spang, Jimmy H. Saw, Steffen L. Jørgensen, Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka, Joran Martijn, Anders E. Lind, Roel van Eijk, Christa Schleper, Lionel Guy et Thijs J. G. Ettema, « Complex archaea that bridge the gap between prokaryotes and eukaryotes », Nature,‎ (ISSN 0028-0836, DOI 10.1038/nature14447, lire en ligne [PDF])
  2. ↑ (en) Steffen Leth Jørgensen, Bjarte Hannisdal, Anders Lanzen, Tamara Baumberger, Kristin Flesland, Rita Fonseca, Lise Øvreås, Ida H Steen, Ingunn H Thorseth, Rolf B Pedersen et Christa Schleper, « Correlating microbial community profiles with geochemical data in highly stratified sediments from the Arctic Mid-Ocean Ridge », PNAS, vol. 109, no 42,‎ , E2846–E2855 (DOI 10.1073/pnas.1207574109, lire en ligne)
  3. ↑ (en) Steffen Leth Jørgensen, Ingunn H Thorseth, Rolf B Pedersen, Tamara Baumberger et Christa Schleper, « Quantitative and phylogenetic study of the Deep Sea Archaeal Group in sediments of the Arctic mid-ocean spreading ridge », Frontiers in Microbiology,‎ (DOI 10.3389/fmicb.2013.00299, lire en ligne)
  4. ↑ Fabien Goubet, « Loki, vieille cousine venue du fond des mers », sur Le Temps, (consulté le )
  5. ↑ « Une nouvelle organisation du vivant », sur Le Temps, (consulté le )
  6. ↑ (en) Paul Rincon, « Newly found microbe is close relative of complex life », sur BBC News, (consulté le )
  7. ↑ (en) Carl Zimmer, « Under the Sea, a Missing Link in the Evolution of Complex Cells », sur New York Times, (consulté le )
  8. ↑ (en) S. Kelly, B. Wickstead et K. Gull, « Archaeal phylogenomics provides evidence in support of a methanogenic origin of the Archaea and a thaumarchaeal origin for the eukaryotes », Proceedings of the Royal Society B, vol. 278,‎ , p. 1009–1018 (DOI 10.1098/rspb.2010.1427, lire en ligne, consulté le )
  9. ↑ (en) John M. Archibald, « The eocyte hypothesis and the origin of eukaryotic cells », PNAS, vol. 105, no 51,‎ , p. 20049–20050 (DOI 10.1073/pnas.0811118106, lire en ligne, consulté le )
  10. ↑ ,(en) Anthony M. Poole et Nadja Neumann, « Reconciling an archaeal origin of eukaryotes with engulfment: a biologically plausible update of the Eocyte hypothesis », Research in Microbiology, vol. 162,‎ , p. 71–76 (DOI 10.1016/j.resmic.2010.10.002, lire en ligne, consulté le )
  11. ↑ (en) Lionel Guy et Thijs J. G. Ettema, « The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes », Trends in Microbiology, vol. 19, no 12,‎ , p. 580–587 (PMID 22018741, DOI 10.1016/j.tim.2011.09.002, lire en ligne, consulté le )
  12. ↑ (en) Cymon J. Cox, Peter G. Foster, Robert P. Hirt, Simon R. Harris et T. Martin Embley, « The archaebacterial origin of eukaryotes », PNAS, vol. 1105,‎ , p. 20356–20361 (DOI 10.1073/pnas.0810647105, lire en ligne, consulté le )

Voir aussi

Phylum d'archées (nom scientifique) (8)
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