Spoligotypage

Le spoligotypage, de l'anglais Spacer Oligonucleotide typing, est une technique de génotypage permettant d'identifier des séquences DR (Direct Repeat) au sein de la région CRISPR[1]. Il existe un fort polymorphisme de ces séquences DR, par exemple dans le complexe Mycobacterium tuberculosis.

Cette technique permet d'identifier des sous-espèces de Mycobacterium tuberculosis (sous-espèces tuberculosis, bovis, africanum, etc).

Notes et références

  1. ↑ (en) Gary Napier, David Couvin, Guislaine Refrégier et Christophe Guyeux, « Comparison of in silico predicted Mycobacterium tuberculosis spoligotypes and lineages from whole genome sequencing data », Scientific Reports, vol. 13, no 1,‎ , p. 11368 (ISSN 2045-2322, PMID 37443186, PMCID PMC10345134, DOI 10.1038/s41598-023-38384-3, lire en ligne Accès libre, consulté le )
Méthode en génétique (19)
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