Fusarium

Fusarium

Classification

Règne	Fungi
Division	Ascomycota
Classe	Sordariomycetes
Sous-classe	Hypocreomycetidae
Ordre	Hypocreales
Famille	Nectriaceae

Genre

Fusarium
Link (1809)

Fusarium est un genre de champignons imparfaits (deutéromycètes).

Les formes parfaites (téléomorphes) de quelques espèces de Fusarium sont connues, et appartiennent à la classe des Ascomycètes (ordre des Hypocréales, famille des Nectriacées, genres Gibberella, Calonectria, et Nectria). Pour plusieurs espèces de Fusarium, le stade parfait demeure inconnu.

Dans ce genre, plusieurs espèces causent une maladie des plantes, dite « fusariose ». Certaines espèces sont impliquées dans des infections opportunistes chez l'homme et chez l'animal. Plusieurs espèces peuvent produire des mycotoxines.

Le genre Fusarium tire son nom du latin fusus car ses spores sont en forme de fuseau.

Le principal caractère morphologique des espèces de Fusarium est la présence de macroconidies fusiformes et cloisonnées.

La culture de Fusarium en laboratoire est en général aisée sur les milieux usuels de mycologie (gélose Sabouraud + Chloramphénicol), on obtient des colonies au bout de 3 à 7 jours à 25°C.

Le genre Fusarium regroupe plusieurs espèces phytopathogènes susceptibles d’attaquer un grand nombre de plantes, provoquant des maladies appelées fusarioses.

Ces champignons infectent de nombreuses céréales, graminées et autres plantes, et ils survivent dans les graines, dans les résidus de culture et dans le sol. À l'automne, favorisés par les sols humides, ils envahissent le collet, les racines ou les gaines foliaires. À ce stade, ils peuvent provoquer la pourriture des semences et la fonte des semis. Au printemps, ils sont favorisés par les sols secs et la forte concentration d'engrais. Les lésions continuent de s'étendre, donnant lieu à la pourriture du collet, de la tige et des racines.

Les semences pourrissent ou les plantules meurent avant leur levée. Chez les plantules qui lèvent, la croissance est arrêtée et le collet, les racines ou la base de la tige présentent une pourriture allant du brun au brun rouge.

Le champignon se conserve dans le sol grâce à ses chlamydospores et au mycélium capable de survivre sur les débris. La dissémination se fait au niveau du sol par les eaux de ruissellement, le vent ou les éclaboussures ou les importations dans l'exploitation de terreaux ou de plants contaminés.

Certaines espèces saprophytes sont accessoirement capables de se développer en tant que pathogènes secondaires sur des tissus végétaux sénescents.

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Popolon

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• En Languedoc-Roussillon, une espèce de Fusarium s'est attaqué à l'asperge et a rendu la terre des parcelles touchées impropres à sa culture plusieurs années.
• Au Maghreb, une espèce de Fusarium est responsable du bayoud, maladie du palmier dattier qui a détruit les deux tiers des palmeraies du Maroc.
• Des espèces de Fusarium s'attaquent aussi au blé, à l'orge, au maïs, à l'avoine, à la tomate, au melon, au concombre, à la courgette, au topinambour, au piment, à la pomme de terre, à la patate douce, à la pastèque, au céleri, à l'ail, à l'oignon, au chou, au gingembre, à la banane, au manioc, aux fleurs d’ornement et à beaucoup d’arbres fruitiers.
• À Madagascar, la fusariose détruit chaque année, des centaines d'hectares de plantation de vanille.
• La maladie de Panama ou fusariose du bananier est due à Fusarium oxysporum. Cette maladie tue les bananiers plus ou moins rapidement.

Des champignons du genre Fusarium sont connus pour leur aptitude à synthétiser certaines mycotoxines sur la plante, certaines toxines n'étant synthétisées que par certaines espèces. Les quantités et les types de mycotoxines varient selon les souches de fusarium présents sur les plants. Aujourd'hui, les principales mycotoxines surveillées dans les produits alimentaires sont la déoxynivalénol (DON) et la zéaralénone (ZEA) produites par F. graminearum. On les retrouve à la récolte, dans l’immense majorité des cas en d’infimes quantités (quelques ppm voire ppb), mais des pics de contamination sont parfois observés.

Depuis une vingtaine d’années, on sait que certaines espèces de Fusarium sont susceptibles de réaliser de graves infections opportunistes surtout chez les personnes immuno-déprimées. Les spores de Fusarium aéroportées et inhalés, ou ingérées avec la nourriture, peuvent être une source importante de problèmes de santé,

Les symptômes peuvent inclure la nausée, le vomissement, la diarrhée, la dermatite et hémorragie interne. Les spores peuvent se développer sur les yeux (première cause de kératomycose), dans les sinus, sur la peau et les ongles et sont susceptibles de provoquer de la fièvre des foins et l'asthme. Ils causent fréquemment des lésions de la peau chez les patients brûlés, des mycoses des ongles, de l'otomycose, des ulcères variqueux, le mycétome, des ostéomyélites ou des infections disséminées.

Les infections dues aux différentes espèces de Fusarium sont collectivement regroupées sous le terme de « fusarioses ».

Quelques espèces (Fusarium du groupe roseum) peuvent produire de puissantes toxines (mycotoxines), qu'on trouve parfois en concentrations significatives sur des grains ou des produits dérivés. Ingérées par des animaux ou par l'homme, elles peuvent provoquer de graves intoxications alimentaires, éventuellement mortelles, avec risque cancérigène. Ces toxines peuvent affecter les systèmes circulatoire, digestif, cutané et nerveux.

• Fusarium euwallaceae
• Fusarium tricinctum
• Fusarium poae
• Fusarium langsethiae
• Fusarium du groupe roseum qui contient les espèces : Fusarium graminearum, Fusarium culmorum, Fusarium arthrosporioides et Fusarium avenaceum, entre autres.
• Fusarium moniliforme variété subglutinans
• Fusarium oxysporum
• Fusarium solani

• • Fusarium solani
  • Fusarium avenaceum
  • Fusarium culmorum
  • Fusarium graminearum
  • Fusarium moniliforme
  • Fusarium oxysporum
  • Fusarium poae
  • Fusarium proliferatum
  • Fusarium sporotrichioides
  • Fusarium subglutinans
  • Fusarium tricinctum

• • Fusarium acuminatum
  • Fusarium equiseti
  • Fusarium lateritium
  • Fusarium sambucinum

• Microdochium nivale ou Monographella nivalis var. nivalis

Monographella nivalis var. nivalis ne fait pas partie des Fusarium, mais ce champignon provoque une maladie évoquant la fusariose sur les épis de blé, raison pour laquelle il est souvent confondu avec Fusarium.

La taxinomie du genre est complexe. Un certain nombre de schémas différents ont été envisagés et jusqu'à mille espèces ont été identifiées à certains moments, selon les concepts de spéciation larges ou étroits adoptés par les auteurs^[1],[2],[3].

Les études phylogénétiques indiquent sept clades principaux dans le genre^[3].

Divers schémas ont conduit à subdiviser le genre en sous-genres et en sections. Il existe cependant une mauvaise corrélation entre les sections et les clades phylogénétiques^[3]

Les sections précédemment décrites sont notamment :

Selon Catalogue of Life (8 avril 2017)^[4] :

• Identifier les champignons transmis par les semences, R. Champion, INRA éditions, 1997.
• (en) Common Laboratory Seed Health Testing Methods for Detecting Fungi, S.B. Mathur et Olga Kongsdal, publication ISTA, 2003.
• (en) P E Nelson, M C Dignani et E J Anaissie, « Taxonomy, biology, and clinical aspects of Fusarium species », Clin Microbiol Rev, vol. 7, n^o 4,‎ octobre 1994, p. 479–504 (PMID 7834602, PMCID 358338).
• (en) Antonio Moretti, « Taxonomy of Fusarium genus: A continuous fight between lumpers and splitters », Zbornik Matice srpske za prirodne nauke, n^o 117,‎ 2009, p. 7–13 (DOI 10.2298/ZMSPN0917007M, lire en ligne).
• (en) Maiko Watanabe, Takahiro Yonezawa, Ken-ichi Lee, Susumu Kumagai, Yoshiko Sugita-Konishi, Keiichi Goto et Yukiko Hara-Kudo, « Molecular phylogeny of the higher and lower taxonomy of the Fusarium genus and differences in the evolutionary histories of multiple genes », BMC Evolutionary Biology, vol. 11, n^o 1,‎ 2011, p. 322 (PMID 22047111, PMCID 3270093, DOI 10.1186/1471-2148-11-322, lire en ligne, consulté le 8 avril 2017).

• Mycose, Champignon
• Fusariose, Mycotoxine
• Deutéromycètes

• (en) Référence Catalogue of Life : Fusarium (consulté le 11 décembre 2020)
• (en) Référence Index Fungorum : Fusarium Link 1809 (+ liste espèces) (+ MycoBank) (consulté le 8 avril 2017)
• http://www.inspq.qc.ca/moisissures/fiche.asp?no=17

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