Enterobacteriaceae

Enterobacteriaceae
Description de cette image, également commentée ci-après
E. coli ici observée au microscope électronique est l'une des Entérobactéries les plus connues
Classification LPSN
Domaine Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Enterobacterales

Famille

Enterobacteriaceae
Rahn 1937

Les Enterobacteriaceae sont une famille de bacilles Gram négatifs de l'ordre des Enterobacterales. Leur nom provient de Enterobacter qui est l'un des genres, mais exceptionnellement pas le genre type, de cette famille : le genre type des Enterobacteriaceae est Escherichia. C'est de loin la plus grande famille de l'ordre auquel elle appartient.

« Entérobactéries » est un terme imprécis sur le plan taxonomique mais largement utilisé pour désigner des bactéries abondantes dans le tube digestif des Mammifères et dans l'environnement, dotées de certaines caractéristiques biologiques communes. Avant l'ère de la phylogénétique moléculaire, lorsque les familles bactériennes n'étaient définies que par des critères phénotypiques, il pouvait désigner la famille des Enterobacteriaceae. Depuis la refonte de l'ordre des Enterobacterales réalisée en 2016 par Adeolu et al. sur des critères génomiques[1], le périmètre des Enterobacteriaceae a été réduit et ces deux termes ne sont plus synonymes.

Liste de genres

Genres validement publiés

Selon la LPSN (24 octobre 2022)[2] :

Genres reclassés (synonymes)

Selon la LPSN (6 novembre 2022)[3] les genres suivants ont été reclassés au sein de la famille des Enterobacteriaceae :

  • Calymmatobacterium Aragão & Vianna 1913 : reclassé en Klebsiella
  • Koserella Hickman-Brenner et al. 1985 : reclassé en Yokenella
  • Levinea Young et al. 1971 : reclassé en Citrobacter
  • Metakosakonia Alnajar & Gupta 2017 : reclassé en Phytobacter

De plus, le genre Entomohabitans Lee et al. 2022 (fam. Enterobacteriaceae) a été reclassé en Erwinia (fam. Erwiniaceae).

Genres en attente de publication valide

Selon la LPSN (6 novembre 2022)[3] (Ca. signifie Candidatus) :

  • « Aranicola » Schabereiter-Gurtner et al. 2001
  • « Atlantibacter » Hata et al. 2016
  • « Averyella » Johnson et al. 2005
  • « Ca. Blochmaniella » corrig. Sauer et al. 2000
  • « Cloaca » Castellani & Chalmers 1919
  • « Colobactrum » Borman et al. 1944
  • « Ca. Cuticulibacterium » corrig. Wier et al. 2004
  • « Edaphovirga » Xue et al. 2019
  • « Encapsulatus » Castellani & Chalmers 1919
  • « Erythrobacillus » Fortineau 1905
  • « Galloisinimonas » Park et al. 2012
  • « Jejubacter » Jiang et al. 2020
  • « Ca. Macropleicola » Kölsch et al. 2009
  • « Ca. Moranella » McCutcheon & von Dohlen 2011
  • « Nissabacter » Mlaga et al. 2017
  • « Padlewskia » Macierewicz 1966
  • « Paracolobactrum » Borman et al. 1944
  • « Ca. Phloeobacter » corrig. Zreik et al. 1998
  • « Ca. Profftia » Toenshoff et al. 2012
  • « Proshigella » Borman et al. 1944
  • « Pseudenterobacter » Wu et al. 2020
  • « Ca. Regiella » Moran et al. 2005
  • « Ca. Riesia » Sasaki-Fukatsu et al. 2006
  • « Ca. Stammerella » corrig. Mazzon et al. 2008
  • « Superficieibacter » Potter et al. 2018
  • « Ca. Trabutinella » Szabó et al. 2017
  • « Ca. Westeberhardia » Klein et al. 2016
  • « Ca. Williamhamiltonella » corrig. Moran et al. 2005

Notes et références

  1. Adeolu M et al. « Genome-based phylogeny and taxonomy of the ‘Enterobacteriales’: proposal for Enterobacterales ord. nov. divided into the families Enterobacteriaceae, Erwiniaceae fam. nov., Pectobacteriaceae fam. nov., Yersiniaceae fam. nov., Hafniaceae fam. nov., Morganellaceae fam. nov., and Budviciaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2016;66(12):5575–5599. Accès libre.
  2. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 24 octobre 2022
  3. a et b List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 6 novembre 2022

Voir aussi

Articles connexes

Références taxonomiques

Autre référence externe