Coronavirus humain 229E

Le coronavirus humain 229E (nom scientifique Human coronavirus 229E, acronyme HCoV-229E) est une espèce de coronavirus qui infecte les humains et les chauves-souris[2]. Il s'agit d'un virus à ARN simple brin enveloppé, de sens positif, qui pénètre dans sa cellule hôte en se liant au récepteur APN[3]. Avec le coronavirus humain OC43 HCoV-OC43, il est l'un des virus responsables du rhume[4],[5]. L'espèce appartient au genre Alphacoronavirus et au sous-genre Duvinacovirus[6],[7].

Transmission

Le HCoV-229E se transmet via les gouttelettes de la respiration, les postillons et les fomites.

Signes et symptômes

Le HCoV-229E est associé à une gamme de symptômes respiratoires, allant du rhume banal à une morbidité élevée comme la pneumonie et la bronchiolite. Cependant, des cas de une morbidité sévère sont toujours observés dans les cas de co-infection avec d'autres agents pathogènes respiratoires à une seule exception signalée: bien que l'infection par HCoV-229E seul soit presque exclusivement associée à une maladie asymptomatique ou bénigne, il existe à ce jour un seul rapport de cas publié d'infection à HCoV-229E qui a provoqué le syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA) chez un patient par ailleurs en bonne santé et n'ayant aucune co-infection détectable avec un autre agent pathogène[8]. Le HCoV-229E fait également partie des coronavirus les plus fréquemment codétectés avec d'autres virus respiratoires, en particulier avec le virus respiratoire syncytial humain (HRSV)[9],[10],[11].

Épidémiologie

HCoV-229E est l'un des six coronavirus humains qui incluent HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1, MERS-CoV et SARSr-CoV (SARS-CoV-1 et SARS-CoV-2) et est distribué mondialement[12],[13]. Cependant, ces virus ont été détectés dans différentes parties du monde à différentes périodes de l'année[14],[15],[16].

Voir également

Liens externes

  • CDC
  • Virology online
  • Coronavirus
  • Viralzone: Alphacoronavirus
  • Base de données et analyse des agents pathogènes viraux (ViPR): Coronaviridae

Références

  1. (en) « Naming the 2019 Coronavirus », ICTV, (consulté le 11 février 2020).
  2. Lim, Ng, Tam et Liu, « Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions », Diseases, vol. 4, no 3,‎ , p. 26 (ISSN 2079-9721, PMID 28933406, PMCID 5456285, DOI 10.3390/diseases4030026) :

    « See Table 1. »

  3. « Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis », Methods in Molecular Biology, Springer, vol. 1282,‎ , p. 1–23 (ISBN 978-1-4939-2438-7, PMID 25720466, PMCID 4369385, DOI 10.1007/978-1-4939-2438-7_1) :

    « See Table 1. »

  4. Susanna K. P. Lau, Paul Lee, Alan K. L. Tsang, Cyril C. Y. Yip,1 Herman Tse, Rodney A. Lee, Lok-Yee So, Yu-Lung Lau, Kwok-Hung Chan, Patrick C. Y. Woo, and Kwok-Yung Yuen. Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination. J Virology. 2011 November; 85(21): 11325–11337.
  5. E. R. Gaunt,1 A. Hardie,2 E. C. J. Claas,3 P. Simmonds,1 and K. E. Templeton. Epidemiology and Clinical Presentations of the Four Human Coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 Detected over 3 Years Using a Novel Multiplex Real-Time PCR Method down-pointing small open triangle. J Clin Microbiol. 2010 August; 48(8): 2940–2947.
  6. (en) « Virus Taxonomy: 2018 Release », International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), (consulté le 13 janvier 2019)
  7. Woo, Huang, Lau et Yuen, « Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis », Viruses, vol. 2, no 8,‎ , p. 1804–1820 (ISSN 1999-4915, PMID 21994708, PMCID 3185738, DOI 10.3390/v2081803) :

    « Figure 2. Phylogenetic analysis of RNA-dependent RNA polymerases (Pol) of coronaviruses with complete genome sequences available. The tree was constructed by the neighbor-joining method and rooted using Breda virus polyprotein. »

  8. A Rare Case of Human Coronavirus 229E Associated with Acute Respiratory Distress Syndrome in a Healthy Adult. Vassilara F, Spyridaki A, Pothitos G, Deliveliotou A, Papadopoulos A. Case Rep Infect Dis. 2018 Apr 15;2018:6796839. doi: 10.1155/2018/6796839. eCollection 2018. PMID: 29850307 Free PMC Article
  9. Pene, F., A. Merlat, A. Vabret, F. Rozenberg, A. Buzyn, F. Dreyfus, A. Cariou, F. Freymuth, and P. Lebon. 2003. Coronavirus 229E related pneumonia in immunocompromised patients. Clin. Infect. Dis. 37:929–932. [PubMed]
  10. Vabret, A., T. Mourez, S. Gouarin, J. Petitjean, and F. Freymuth. 2003. An outbreak of coronavirus OC43 respiratory infection in Normandy, France. Clin. Infect. Dis. 36:985–989. [PubMed]
  11. Woo, P. C. Y., S. K. P. Lau, H. Tsoi, Y. Huang, R. W. S. Poon, C. M. Chu, R. A. Lee, W. K. Luk, G. K. M. Wong, B. H. L. Wong, V. C. C. Cheng, B. S. F. Tang, A. K. L. Wu, R. W. H. Yung, H. Chen, Y. Guan, K. H. Chan, and K. Y. Yuen. 2005. Clinical and molecular epidemiological features of coronavirus HKU1 associated community acquired pneumonia. J. Infect. Dis. 192:1898–1907. [PubMed]
  12. Fields, B. N., D. M. Knipe, and P. M. Howley (ed.). 1996. Fields virology, 3rd ed. Lippincott-Raven, Philadelphia, PA.
  13. Hoek, L. van der, P. Krzysztof, and B. Berkhout. 2006. Human coronavirus NL63, a new respiratory virus. FEMS Microbiol. Rev. 30:760–773. [PubMed]
  14. Esper, F., C. Weibel, D. Ferguson, M. L. Landry, and J. S. Kahn. 2006. Coronavirus HKU1 infection in the United States. Emerg. Infect. Dis. 12:775–779. [PMC free article] [PubMed]
  15. Gerna, G., E. Percivalle, A. Sarasini, G. Campanini, A. Piralla, F. Rovida, E. Genini, A. Marchi, and F. Baldanti. 2007. Human respiratory coronavirus HKU1 versus other coronavirus infections in Italian hospitalised patients. J. Clin. Virol. 38:244–250. [PubMed]
  16. Kaye, H. S., H. B. Marsh, and W. R. Dowdle. 1971. Seroepidemiologic survey of coronavirus (strain OC 43) related infections in a children's population. Am. J. Epidemiol. 94:43–49. [PubMed]