Coronaviridae

Coronaviridae
Description de cette image, également commentée ci-après
Coronavirus humain
Classification
Type Virus
Groupe Groupe IV
Ordre Nidovirales

Famille

Coronaviridae
— auteur incomplet —, date à préciser

Genres de rang inférieur

Coronaviridae est une famille de virus à ARN simple brin enveloppés, de sens positif. Le génome viral mesure de 26 à 32 kb. Les particules, quasi-sphériques, sont généralement décorées de grandes projections de surface (~ 20nm), en forme de massue ou de pétale (les péplomères ou "spikes" en anglais), qui créent une image qui rappelle la couronne solaire en micrographie électronique: cette propriété est à l'origine du nom des virus de cette famille, les "coronavirus".

Structure

Schéma de la structure d'un virion de coronavirus

Les extrémités 5 'et 3' du génome ont une coiffe et une "queue" poly(A), respectivement. L'enveloppe virale, obtenue par bourgeonnement à travers les membranes du réticulum endoplasmique (RE) et / ou de l'appareil de Golgi, contient invariablement deux espèces de (glyco)protéines codées par le virus, S et M. La glycoprotéine S comprend les grandes projections de surface, tandis que la protéine M est une protéine transmembranaire.

Les torovirus et un sous-ensemble de coronavirus (en particulier les membres du sous-groupe A du genre Betacoronavirus) possèdent, en plus des peplomères composés de S, un deuxième type de projections de surface composé de la protéine hémagglutinine-estérase.

Une autre protéine structurelle importante est la phosphoprotéine N, qui est responsable de la symétrie hélicoïdale de la nucléocapside qui renferme l'ARN génomique.

Taxonomie

La famille Coronaviridae est organisée en 2 sous-familles, 5 genres, 23 sous-genres et une quarantaine d'espèces[1]:

  • Famille Coronaviridae
    • Sous-famille Letovirinae
      • Genre Alphaletovirus
        • Sous-genre Milecovirus
          • Microhyla letovirus 1
    • Sous-famille Orthocoronavirinae
      • Genre Alphacoronavirus
        • Sous-genre Colacovirus
          • Bat coronavirus CDPHE15
        • Sous-genre Decacovirus
          • Bat coronavirus HKU10
          • Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
        • Sous-genre Duvinacovirus
          • Human coronavirus 229E
        • Sous-genre Luchacovirus
          • Lucheng Rn rat coronavirus
        • Sous-genre Minacovirus
          • Ferret coronavirus
          • Mink coronavirus 1
        • Sous-genre Minunacovirus
          • Miniopterus bat coronavirus 1
          • Miniopterus bat coronavirus HKU8
        • Sous-genre Myotacovirus
          • Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
          • Nyctacovirus
          • Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
        • Sous-genre Pedacovirus
          • Porcine epidemic diarrhea virus
          • Scotophilus bat coronavirus 512
        • Sous-genre Rhinacovirus
          • Rhinolophus bat coronavirus HKU2
        • Sous-genre Setracovirus
          • Human coronavirus NL63
          • NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
        • Sous-genre Tegacovirus
          • Alphacoronavirus 1
      • Genre Betacoronavirus
      • Genre Gammacoronavirus
      • Genre Deltacoronavirus
        • Sous-genre Andecovirus
          • Wigeon coronavirus HKU20
        • Sous-genre Buldecovirus
          • Bulbul coronavirus HKU11
          • Coronavirus HKU15
          • Munia coronavirus HKU13
          • White-eye coronavirus HKU16
        • Sous-genre Herdecovirus
          • Night heron coronavirus HKU19
        • Sous-genre Moordecovirus
          • Common moorhen coronavirus HKU21

Épidémiologie et pathologie

Les coronavirus sont transmis par voie fécale-orale ou par aérosols de sécrétions respiratoires. Ils sont présents dans le monde entier et infectent une large diversité de mammifères et d'oiseaux.

Bien que la plupart des maladies soient bénignes chez l'homme, elles peuvent parfois provoquer des situations plus graves, notamment des infections des voies respiratoires : syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) et maladie à coronavirus 2019 (Covid-19). Ils peuvent également provoquer des infections entériques chez les très jeunes enfants et, dans de rares situations, des syndromes neurologiques.

Notes et références

  1. (en) « Virus taxonomy: 2018b release », sur ICTV online, (consulté le 24 janvier 2020)

Liens externes